荧光显微镜是一种重要的生物学研究工具，其原理基于分子在特定波长下的荧光发射现象。在显微镜中，样本首先用荧光染料标记，这些染料能吸收来自引发光源的能量，然后在差别波长下发射出荧光。

当样本置于荧光显微镜下，引发光源照射样本时，样本中的荧光染料分子会吸收能量，进入引发态。但随后，这些引发态分子会迅速退回到基态，释放出荧光，其波长通常比引发光长。这发出的荧光通过镜头和滤光片被收集和疏散，然后被传送到成像系统，显示出样本的荧光图像。

荧光显微镜具有高灵敏度和选择性，允许研究特定分子和结构。通过使用差别的荧光染料，研究者能够标记差别的分子并进行多通道成像，揭示细胞和生物体内庞大的生化历程。别的，荧光显微镜也在医学诊断、药物研发和病毒追踪等领域发挥着重要作用。

总之，荧光显微镜的原理是基于荧光染料在引发光源引发下发射荧光的特性，通过这一原理，研究者可以实现高区分率、高灵敏度的生物成像，深入探究生物体内的分子机制。